The story takes place in Japan in the early 21st century, in an alternate reality where the Tokugawa Shogunate has remained in power. In this reality, student councils are tasked with oppressing schools. Yagyuu Muneakira is a high school student who rebels against his student council with the help of girls who've had the names of famous samurai heroes passed on to them.
เรื่องราวในประเทศ ไดนิปอน กับเรื่องเล่าของ มาสเตอร์ซามุไรในตำนาน ผู้ที่มีความสามารถในการต่อสู้ที่เหนือกว่านักรบทั้งปวง กับพลังที่ได้รับมาจากการทำพันธสัญญากับโชกุนผู้ปรกครองประเทศ แต่ ปัจจุบันไม่มีมาสเตอร์ซามุไรปรากฎตัวมาเป็นเวลานานแล้ว

จนเมื่อ ยางิว มุเนะอากิระ ปรากฎตัวที่โรงฝึกดาบโรงเรียนบุโออุ และได้บังอิญไปทำพันธสัญญาด้วยการ “จูบ” กับหญิงสาวลึกลับและทำให้เธอคนนั้นกลายร่างเป็น ยางิวจูเบ มาสเตอร์ซามุไรที่ไร้เทียมทาน นั่นทำให้อำนาจมืดทั้งหลายต่างต้องการครอบครองพลังของ มาสเตอร์ซามุไรคนใหม่ เพื่อใช้เป็นพลังเพื่อยึดครองประเทศนี้ แต่ มุเนะอากิระ เห็นความไม่ชอบมาพากลนั้นจึงพยายามใช้พลังของ มาสเตอร์ซามุไร เพื่อความถูกต้อง

ความสนุกไม่ได้อยู่ที่ตัว มาสเตอร์ซามุไร ซะทีเดียว แต่กลับเป็นความสามารถของ มุเนะอากิระ ที่เมื่อ “จูบ” ใครเข้าคนนั้นก็จะแปลงร่างเป็นมาสเตอร์ซามุไรผู้เก่งกาจ ทำให้โรงฝึกดาบกลายเป็นฮาเรมรวมสาวสวยไปในทันที กับตัวละครสาวสวยที่ใช้ชื่ออ้างอิงจากบุคคลในยุคเซนโกคุ เช่น ซึนาดะ ยูคิมุระ, โตกุกาวา เซน, ฮัตโตริ ฮันโซ, ลิงลม ซาซึเกะ ชื่อที่ว่ามานี้ล้วนเป็นสาวงามทั้งสิ้น แถมทุกตอนที่ดูยังประกอบไปด้วยฉากเซอวิสวาบหวิบ แบบไม่มีอะไรมาปิดบัง เรียกว่าเห็นจะจะกันเลยทีเดียว